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FAT，即文件分配表（File Assign Table)，是從MS—DOS沿用至今的文件系統，其中FAT32是FAT16的增強版本。FAT32可在MS—DOS，Windows95/98/ME/XP下使用，但Windows NT不支持FAT。另，RISC（精簡指令集計算技術）計算機，只支持FAT。NTFS，即NT文件系統（NT File System），微軟在NT中開始使用的文件系統，在2000和XP下也當然支持。FAT和NTFS文件的命名都有一定要求，他們大同小異，無關痛癢。FAT和NTFS最主要的區別在于：1、NTFS內置了本地安全性，比如：2000和XP的本地文件和目錄的安全保護，FAT沒有內置本地安全性。2、NTFS在分區和格式化的時候會寫入一些“冗余”信息，系統的開銷遠比FAT大。3、最大的FAT分區和FAT文件為 4GB，而NTFS為 2TB（大約2000GB）。4、對于小于400M的分區，FAT的效率明顯高于NTFS。當前情況下，用戶的分區大小一般就幾G到幾十G，FAT和NTFS的性能大致相當，但FAT有這樣的問題，它會隨著文件的大量增加而導致性能的逐步下降。5、NTFS的一些優點：支持文件壓縮，非壓縮格式文件（常見的音頻和視頻文件是壓縮過的）的壓縮效率大約在40%~50%左右。NTFS也具有很好的可恢復性，他利用事務日志自動記錄所有的文件和目錄的更新。NTFS也支持熱修復（HOT FIX），即由于硬盤上的壞扇區而產生寫錯誤，NTFS會自動將數據寫到好的扇區，并對壞扇區做出表識。NTFS分區上也不太會產生文件碎片。作為一般的計算機用戶，在使用中會感覺到FAT的速度會明顯快于NTFS，而事實也是如此。