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　　自然界的植物多數是二倍體(2n=2x)，即其體細胞(2n)核中包含兩個相同的染色體組(x)。但有些物種經過染色體的自然或人工加倍，可形成含有多個染色體組的新物種，我們稱之為多倍體。常見多倍體有三、四、五、六和八穆體，2n分別等于3x、4x、5x、6x和8x。如多倍體的各染色體組來自同一物種，稱之為同源多倍體。　　小麥、煙草、甘著為異源多倍體，馬鈴薯、苜蓿則為同源多倍體。在作物中無論是二倍體還是多倍體，其正常配子細胞的染色體數都是體細胞的一半，又稱單倍性(n)，這種單倍性細胞經人工誘導也可發育成植株，稱做單倍體植株。單倍體及其它體細染色體組數為奇數者(如三倍體、五倍體)均表現高度不育，原因在于其無法實現正常的減數分裂。另外一個現象是單倍體植株細弱、矮小，而多倍體植株則往往表現為根、莖、葉、花的巨型性，可使作物產量增加、品質改良、對育種者極具魅力。1937年發現了能使染色體加倍的化學藥物秋水仙素，為單倍體、多倍體的應用奠定了基礎。單倍體育種不妨以花藥培養為例。我們知道單倍體自身不育，但是如能將其染色體加倍便成了正常可育株。花藥培 養育種法就是取Fl代的花藥置于特定的培養基上培養，利用細胞的全能性，誘導花粉長成植株，這些單倍體植株再經秋水仙素處理一段時間，便可實現染色體加倍，加倍后的植株不僅正常可育，而且完全純合。由于Fl代植株所形成的花粉帶有其雙親的染色體，類型豐富，所以，由其花藥落到的純 合株也是雙親的重組型，只不過已成純系而已。這些單株種成的株行都將是整齊一致的，不再分離,好的便可以留作下年測產。看得出其一次性地純合不僅縮短了育種年限，還有利 于隱性基因的表現，排除了雜種優勢的干擾，選擇又是以株行為單位，容易選準。70年代以來我國用花藥培養法相繼育成煙草、小麥、水稻等作物新品種，奠定了我國在此領域中的世界領先地位。 對多倍體研究發現，五倍體以上的同源多倍體巨型效應。反而減小，生理功能也衰退，所以，同源多倍體育種一般限于二倍體合成四倍體或通過二倍體和四倍體雜交合成三倍體，如無籽西瓜、多倍體甜菜等，都是利用了三倍體的不育性。同源多倍體在減數分裂時往往多條染色體聯合到一起形成多價體，使染色體分離不規則，導致育性下降，結實率低。這 也是為什么二倍體植物的單倍體植株加倍后還是得到二倍體 而非四倍體、八倍體，因為相比之下二倍體細胞分裂正常最具競爭力，一路領先，成了主體。 多倍體育種是創造新物種的過程，這在異源多倍體研究利用上表現得更加淋漓盡致。一般先要做遠緣雜交，而后再給雜種的染色體加倍以合成新物種，此新物種還要通過一系列的改良過程才有可能成為作物。異源多倍體也具有一般多倍體生長旺盛、器官巨大等優點，并且由于染色體組的多樣化，具有永久雜合性(又稱純系優勢)、遺傳上的緩沖性和進化上較強的適應性。 當然，異源多倍體也常因生理上的不協調而造成結實率低、籽粒不飽滿，使得所創造出的異源多倍體物種多數無實用價值，但也不乏小黑麥等成功的先例。隨著科技水平的提高，可以堅信，多倍體育種的前景是廣闊的。。

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單倍體育種是為了得到穩定的純系品種。而多倍體育種是為了得到新品種，這些新品種與二倍體植株相比，莖桿粗壯，葉片、果實和種子都比較大，糖類和蛋白質等營養物質的含量都有所增加。單倍體育種通常采用花藥離體培養，多倍體育種通常是用秋水仙素來處理。