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許多無牙胞厭氧菌是人體的正常菌群。厭O2菌的感染通常是內源性的，來自自身的厭O2菌正常菌群，而它的主要致病因素有毒素、代謝產物、酶和與需O2菌的合并感染。它的易感人群為全身免疫功能低下者，或慢性病患者，如腫瘤，放療，化療病人。嚴重外傷，大面積創傷，口腔胃腸，女性生殖道大手術等。一般來說，臨床厭氧菌感染多以慢性遷延性炎癥或膿腫為主，但也與厭O2菌的數量、種類、部位不同而有差異。厭氧菌在有氧的情況下不能生長。