熱心網友
最主要的一個區別是:是否具有行政主體的地位.國務院組成部門沒有獨立的行政主體地位,除非有法律,法規的授權.國務院直屬機構有著獨立的行政主體資格.
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國務院組成部門依法分別履行國務院基本的行政管理職能。國務院組成部門包括各部、各委員會、中國人民銀行和審計署共41個這些單位的設立，合并，撤銷由總理提出，全國人大決定。國務院直屬機構協助國務院總理辦理專門事項，具有獨立的行政管理職能，他們不是國務院組成人員，他們任免由國務院決定，共有25個。
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國務院組成部門依法分別履行國務院基本的行政管理職能。國務院組成部門包括各部、各委員會、中國人民銀行和審計署。國務院直屬機構主管國務院的某項專門業務，具有獨立的行政管理職能。參考資料：《國務院行政機構設置和編制管理條例》：