我單位是一家公路養護單位，2002年通過公開投標承擔了一條三級公路的路面施工，合同款為300萬元，該工程當年完工，2003年通過了驗收。由于建設款項遲遲不到位，截至今年9月，建設單位一共支付我們260萬元，由于資金沒有完全到位，許多結算沒有結算，許多發票沒有進帳，單位的財務帳上也反映只進成本260萬元。最近審計部門抓住我們沒有進帳的40萬元不放，認為是結余款。我想問問，審計部門對這40萬元很關心，到底想干什么？難道施工單位建設工程不允許節約資金嗎？還有一個問題：我單位為了適應公路大建設的形勢，通過職工集資100多萬元，購買了裝載機、壓路機等施工機械，我們本希望通過這些機械掙些錢為職工辦些福利，但地方稅務局總把這些機械所得認為是單位施工結余，征收33%的企業所得稅，稅務部門這樣做合理嗎？我們在結算和帳務上怎么處理？